MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Escherichia coli APEC O1 plasmid pAPEC-O1-R

Total Repeats: 3749

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009838	AAC	2	6	10	15	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157412015
2	NC_009838	ATCC	2	8	22	29	25 %	25 %	0 %	50 %	157412015
3	NC_009838	TGA	2	6	183	188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157412015
4	NC_009838	GAC	2	6	226	231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157412015
5	NC_009838	CTAT	2	8	253	260	25 %	50 %	0 %	25 %	157412015
6	NC_009838	ATC	2	6	289	294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157412015
7	NC_009838	TG	3	6	362	367	0 %	50 %	50 %	0 %	157412015
8	NC_009838	CAA	2	6	377	382	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157412015
9	NC_009838	CAA	2	6	387	392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157412015
10	NC_009838	GC	3	6	403	408	0 %	0 %	50 %	50 %	157412015
11	NC_009838	TGAT	2	8	506	513	25 %	50 %	25 %	0 %	157412015
12	NC_009838	GTTG	2	8	534	541	0 %	50 %	50 %	0 %	157412015
13	NC_009838	A	6	6	619	624	100 %	0 %	0 %	0 %	157412015
14	NC_009838	TC	3	6	637	642	0 %	50 %	0 %	50 %	157412015
15	NC_009838	TATT	2	8	645	652	25 %	75 %	0 %	0 %	157412015
16	NC_009838	GTT	2	6	675	680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157412015
17	NC_009838	CTT	2	6	712	717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157412015
18	NC_009838	AAG	2	6	797	802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157412015
19	NC_009838	AAG	2	6	840	845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157412015
20	NC_009838	CTTT	2	8	2031	2038	0 %	75 %	0 %	25 %	157412016
21	NC_009838	TGTT	2	8	2110	2117	0 %	75 %	25 %	0 %	157412016
22	NC_009838	CTG	2	6	2118	2123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157412016
23	NC_009838	T	6	6	2131	2136	0 %	100 %	0 %	0 %	157412016
24	NC_009838	GAT	2	6	2160	2165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157412016
25	NC_009838	ATT	2	6	2303	2308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157412016
26	NC_009838	ATG	2	6	2310	2315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157412016
27	NC_009838	CATG	2	8	2391	2398	25 %	25 %	25 %	25 %	157412017
28	NC_009838	CT	3	6	2414	2419	0 %	50 %	0 %	50 %	157412017
29	NC_009838	ACG	2	6	2442	2447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157412017
30	NC_009838	TTTTG	2	10	2499	2508	0 %	80 %	20 %	0 %	157412017
31	NC_009838	A	8	8	2515	2522	100 %	0 %	0 %	0 %	157412017
32	NC_009838	CATT	2	8	2532	2539	25 %	50 %	0 %	25 %	157412017
33	NC_009838	TGT	2	6	2581	2586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157412017
34	NC_009838	AGC	2	6	2587	2592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157412017
35	NC_009838	AGC	2	6	2620	2625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157412017
36	NC_009838	TGG	2	6	2663	2668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157412017
37	NC_009838	T	6	6	2674	2679	0 %	100 %	0 %	0 %	157412017
38	NC_009838	TAG	2	6	2698	2703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157412017
39	NC_009838	ATGA	2	8	2754	2761	50 %	25 %	25 %	0 %	157412018
40	NC_009838	T	6	6	2787	2792	0 %	100 %	0 %	0 %	157412018
41	NC_009838	A	6	6	2794	2799	100 %	0 %	0 %	0 %	157412018
42	NC_009838	AAAG	2	8	2841	2848	75 %	0 %	25 %	0 %	157412018
43	NC_009838	T	6	6	2868	2873	0 %	100 %	0 %	0 %	157412018
44	NC_009838	A	6	6	2881	2886	100 %	0 %	0 %	0 %	157412018
45	NC_009838	TACA	2	8	2925	2932	50 %	25 %	0 %	25 %	157412018
46	NC_009838	T	7	7	3017	3023	0 %	100 %	0 %	0 %	157412018
47	NC_009838	ATGA	2	8	3058	3065	50 %	25 %	25 %	0 %	157412018
48	NC_009838	GTT	2	6	3076	3081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157412018
49	NC_009838	CT	3	6	3119	3124	0 %	50 %	0 %	50 %	157412018
50	NC_009838	T	6	6	3124	3129	0 %	100 %	0 %	0 %	157412018
51	NC_009838	GAGT	2	8	3222	3229	25 %	25 %	50 %	0 %	157412018
52	NC_009838	GTG	2	6	3263	3268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157412018
53	NC_009838	A	6	6	3309	3314	100 %	0 %	0 %	0 %	157412018
54	NC_009838	CGACT	2	10	3344	3353	20 %	20 %	20 %	40 %	157412018
55	NC_009838	ATC	2	6	3378	3383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157412018
56	NC_009838	A	7	7	3472	3478	100 %	0 %	0 %	0 %	157412018
57	NC_009838	TGA	2	6	3544	3549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157412018
58	NC_009838	A	8	8	3552	3559	100 %	0 %	0 %	0 %	157412019
59	NC_009838	GAA	2	6	3624	3629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157412019
60	NC_009838	CAA	2	6	3643	3648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157412019
61	NC_009838	TAA	2	6	3650	3655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157412019
62	NC_009838	ATT	2	6	3711	3716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157412019
63	NC_009838	CAAA	2	8	3750	3757	75 %	0 %	0 %	25 %	157412019
64	NC_009838	CAGC	2	8	3826	3833	25 %	0 %	25 %	50 %	157412019
65	NC_009838	AAT	2	6	3876	3881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157412019
66	NC_009838	CAG	2	6	3960	3965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157412019
67	NC_009838	AAG	2	6	4033	4038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157412019
68	NC_009838	GCC	2	6	4055	4060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157412019
69	NC_009838	TGG	2	6	4061	4066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157412019
70	NC_009838	CTG	2	6	4150	4155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157412019
71	NC_009838	TGG	2	6	4178	4183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157412019
72	NC_009838	TGT	2	6	4228	4233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157412019
73	NC_009838	GAT	2	6	4298	4303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157412019
74	NC_009838	TAC	2	6	4310	4315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157412019
75	NC_009838	AGA	2	6	4400	4405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157412019
76	NC_009838	ACA	2	6	4505	4510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157412019
77	NC_009838	CAG	2	6	4662	4667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157412019
78	NC_009838	GAA	2	6	4728	4733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157412019
79	NC_009838	ATA	2	6	4814	4819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157412019
80	NC_009838	CTGCT	2	10	4838	4847	0 %	40 %	20 %	40 %	157412020
81	NC_009838	TAC	2	6	4894	4899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157412020
82	NC_009838	AT	3	6	4908	4913	50 %	50 %	0 %	0 %	157412020
83	NC_009838	TAA	2	6	4994	4999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157412020
84	NC_009838	GAG	2	6	5050	5055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157412020
85	NC_009838	AGAT	2	8	5126	5133	50 %	25 %	25 %	0 %	157412020
86	NC_009838	ATC	2	6	5147	5152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157412020
87	NC_009838	CGAA	2	8	5217	5224	50 %	0 %	25 %	25 %	157412020
88	NC_009838	CTG	2	6	5327	5332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157412021
89	NC_009838	TAT	2	6	5347	5352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157412021
90	NC_009838	T	6	6	5364	5369	0 %	100 %	0 %	0 %	157412021
91	NC_009838	AAGA	2	8	5381	5388	75 %	0 %	25 %	0 %	157412021
92	NC_009838	A	6	6	5402	5407	100 %	0 %	0 %	0 %	157412021
93	NC_009838	TGT	2	6	5424	5429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157412021
94	NC_009838	GAT	2	6	5432	5437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157412021
95	NC_009838	GAA	2	6	5462	5467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157412021
96	NC_009838	TA	3	6	5478	5483	50 %	50 %	0 %	0 %	157412021
97	NC_009838	GCG	2	6	5519	5524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157412021
98	NC_009838	CAG	2	6	5600	5605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157412021
99	NC_009838	TAATGC	2	12	5719	5730	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	157412021
100	NC_009838	CA	3	6	5800	5805	50 %	0 %	0 %	50 %	157412021
101	NC_009838	AAGG	2	8	5873	5880	50 %	0 %	50 %	0 %	157412021
102	NC_009838	AG	3	6	5882	5887	50 %	0 %	50 %	0 %	157412021
103	NC_009838	TGC	2	6	5965	5970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157412021
104	NC_009838	TTC	2	6	5988	5993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157412021
105	NC_009838	TAT	2	6	6004	6009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157412021
106	NC_009838	TTC	2	6	6052	6057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157412021
107	NC_009838	A	6	6	6092	6097	100 %	0 %	0 %	0 %	157412021
108	NC_009838	TCA	2	6	6102	6107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157412021
109	NC_009838	AAT	2	6	6113	6118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157412021
110	NC_009838	A	6	6	6280	6285	100 %	0 %	0 %	0 %	157412021
111	NC_009838	TTC	2	6	6355	6360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157412021
112	NC_009838	TCG	2	6	6501	6506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157412021
113	NC_009838	TAC	2	6	6509	6514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157412021
114	NC_009838	AAC	2	6	6528	6533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157412021
115	NC_009838	A	8	8	6646	6653	100 %	0 %	0 %	0 %	157412022
116	NC_009838	A	7	7	6687	6693	100 %	0 %	0 %	0 %	157412022
117	NC_009838	ACA	2	6	6708	6713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157412022
118	NC_009838	A	8	8	6713	6720	100 %	0 %	0 %	0 %	157412022
119	NC_009838	A	6	6	6742	6747	100 %	0 %	0 %	0 %	157412022
120	NC_009838	TATT	2	8	6756	6763	25 %	75 %	0 %	0 %	157412022
121	NC_009838	TTC	2	6	6765	6770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157412022
122	NC_009838	ATT	2	6	6789	6794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157412022
123	NC_009838	CTG	2	6	6922	6927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157412022
124	NC_009838	GAA	2	6	6948	6953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157412022
125	NC_009838	ACCGTG	2	12	6979	6990	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	157412022
126	NC_009838	ATT	2	6	6999	7004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157412022
127	NC_009838	AAG	2	6	7107	7112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157412022
128	NC_009838	GGC	2	6	7155	7160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157412023
129	NC_009838	CTAA	2	8	7207	7214	50 %	25 %	0 %	25 %	157412023
130	NC_009838	TGC	3	9	7221	7229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157412023
131	NC_009838	GGCAAA	2	12	7236	7247	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	157412023
132	NC_009838	GGC	2	6	7252	7257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157412023
133	NC_009838	TGG	2	6	7335	7340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157412023
134	NC_009838	TTG	2	6	7421	7426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157412023
135	NC_009838	AGA	2	6	7458	7463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157412023
136	NC_009838	TTA	2	6	7481	7486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157412023
137	NC_009838	TGA	2	6	7491	7496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157412023
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261	NC_009838	TTA	2	6	18431	18436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157412027
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265	NC_009838	ATT	2	6	18686	18691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157412028
266	NC_009838	CTG	2	6	18694	18699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157412028
267	NC_009838	TAAA	2	8	18742	18749	75 %	25 %	0 %	0 %	157412028
268	NC_009838	TTAG	2	8	18822	18829	25 %	50 %	25 %	0 %	157412028
269	NC_009838	T	6	6	18834	18839	0 %	100 %	0 %	0 %	157412028
270	NC_009838	ATA	2	6	18904	18909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157412028
271	NC_009838	T	7	7	18925	18931	0 %	100 %	0 %	0 %	157412028
272	NC_009838	TTA	2	6	18983	18988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157412029
273	NC_009838	TAAC	2	8	19016	19023	50 %	25 %	0 %	25 %	157412029
274	NC_009838	AGAGAA	2	12	19034	19045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157412029
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282	NC_009838	CAGT	2	8	19410	19417	25 %	25 %	25 %	25 %	157412029
283	NC_009838	ATC	2	6	19448	19453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157412029
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287	NC_009838	TTC	2	6	19653	19658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157412030
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292	NC_009838	ACC	2	6	20113	20118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157412030
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298	NC_009838	TTGT	2	8	20348	20355	0 %	75 %	25 %	0 %	157412031
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